高解析离子淌度质谱(HDMS)

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比较蛋白质组学是蛋白质组学研究中应用最广泛的领域，可用于疾病标志物研究、不同条件刺激下生物体或细胞的变化等不同领域。一般情况下，蛋白组研究中质谱的主要功能是鉴定蛋白质，定量是通过其它方法实现，如标记或染色等。目前，不借助其它方法，质谱可同时实现蛋白质的定性和定量，即label-free 定量蛋白质组研究。

＝＝＝＝三种定量蛋白组学的平均偏差＝＝＝＝
来自ABRF评测结果：http://abrf.org/index.cfm/group.show/Proteomics.34.htm

Gel Based Methods: 36%
Isotopic Labeling Methods :42%
Ion Current Methods (Label-free): 23%

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蛋白质是生命功能的主要执行者，许多蛋白质的功能发挥是通过蛋白质相互作用实现的。研究蛋白质的相互作用是研究蛋白质功能和作用机制的重要内容。蛋白质相互作用网络研究是蛋白质组学研究的重要内容之一。

＝＝＝＝＝＝研究蛋白质复合物的难点＝＝＝＝＝＝

1. 蛋白质相互作用是非共价结合，有功能的相互作用往往很弱，不易检测到。
2. 蛋白质相互作用是个动态过程，结合或解离的时间有时很短。
3. 细胞或组织中大量的高丰度蛋白质影响低丰度相互作用蛋白的检测。

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1．分子量测定
2．精确质量测定及元素组成分析  
3．多肽de novo测序
4．蛋白质鉴定及数据库检索
5．突变点及修饰点分析(乙酰化、磷酸化、 糖基化 )
6．二硫键分析       
7．有机物串联质谱  
8．简单混合物分析

小分子化合物、蛋白质、多肽
小分子化合物、多肽
蛋白质
蛋白质及多肽
蛋白质
蛋白质
小分子化合物
小分子化合物、蛋白质、多肽

1. 样品可为冻干粉、溶液或胶内蛋白质（必须为考染），冻干粉、溶液应无盐。样品如有毒性或腐蚀性或需特殊保存的样品，请事先声明。
2. 电喷雾质谱由于其耐盐性差，样品分析前需要脱盐，会损失部分样品，因此，在鉴定胶内酶切的样品时所需的样品量较MALDI-TOF-MS多。
3. 填写样品申请单应完整，包括样品名称、性质、数量；送样人姓名、单位、联系电话、单位地址，课题名称等所有样品申请单的各项内容。
4. 网上填写样品申请单：http://www.proteomics.com.cn/2005/userdata/user_online.asp